大发快3免费破解版软件云南发现一种新蝙蝠冠状病毒 力证新冠起源于自然

  • 时间:
  • 浏览:1
  • 来源:极速快三--极速快三计划

(原标题:云南一种新蝙蝠冠状病毒力证新冠起源于自然!提示重组线索)

新冠病毒是如保在自然界发生重组?中国科学院西双版纳热带植物园在云南新发现的另一种蝙蝠冠状病毒,为中外科学家提供了解开你什儿 谜题的新线索。

你什儿 新发现的蝙蝠冠状病毒的Spik大发快3免费破解版软件E蛋白的S1大发快3免费破解版软件和S2亚单位的剪切位点处有多个氨基酸插入,揭示了新冠病毒(HCoV-19)的S蛋白S1/S2剪切位点的自然插入和新冠病毒的将会重组来源。S蛋白是新冠病毒与人类细胞受体ACE2结合的关键,为宜进入人体细胞的“钥匙”。而上述剪切位点的插入此前被持阴谋论者的人认为是人工干预。

以上科大发快3免费破解版软件研成果来自中外联合科研团队,由山东第一医科大学、山东省高等学校新发传染病病因流行病学实验室、中国科学院西双版纳热带植物园、中国科学院北京生命科学研大发快3免费破解版软件究所、中国科学院武汉病毒研究所、中国科学院微生物研究所、澳大利亚悉尼大学联合团队的研究人员于当地时间3月5日发表在预印本网站bioRxiv上,论文尚未经同行评议。

在这篇论文中,研究团队报告了一种新的蝙蝠来源冠状病毒,命名为RmY大发快3免费破解版软件N02,是在2019年5月至10月期间从中国云南省采集的227只蝙蝠的基因组分析中鉴定出来的。

研究显示,RmYN02和新型冠状病毒HCoV-19在全病毒基因组中的同源性为93.3%,在与HCoV-19最接近的1ab基因中的同源性为97.2%。相比之下,RmYN02受体结合域(RBD)与HCoV-19之间呈现低序列同源性(61.3%),将会不与血管紧张素转换酶2(ACE2)结合。

然而,与HCoV-19类似于 ,RmYN02的特点是在S蛋白的S1和S2亚单位的剪切位点处有多个氨基酸插入。研究团队认为,这前要力证明了你什儿 插入事件在自然界中是还促进发生的。

哪些数据表明,HCoV-19源于蝙蝠和你什儿 野生动物中发生的病毒之间的多重自然重组。

该论文通讯作者为山东第一医科大学基础医学院病原生物学研究所所长、山东省高等学校新发传染病病因流行病学实验室主任史卫峰,中国科学院微生物研究所病毒传播预警与致病机制研究组组长、项目研究员毕玉海,中国科学院西双版纳热带植物园综合保护中心景观生态组组长、副教授Alice Catherine Hughes。

新冠病毒起源尚不明确,野生动物中仍有一定量冠状病毒

HCoV-19在中国及你什儿 地区造成了前所未有的肺炎流行,已引起全球范围的公共卫生关注。尽管蝙蝠被认为是HCoV-19最有将会的自然宿主,但病毒的起源仍不清楚。

论文中提到,在对疫情早期的几例HCoV-19病例的流行病学调查显示,大多数人在发病前曾去过武汉市华南海鲜市场,该市场有各种野生动物出售,最终已于2020年1月1日关闭。

系统发育分析表明,HCoV-19是一种不同于SARS-CoV和MERS-CoV的新型冠状病毒。到目前为止,与HCoV-19最密切相关的病毒是RaTG13,它是中科院武汉病毒所石正丽团队于2013年在云南采集的一只中华菊头蝠标本中分离发现。RaTG13病毒株和新冠病毒具有96.1%的核苷酸同源性、92.9%的S基因同源性。哪些数据再次说明蝙蝠是冠状病毒的重要宿主。

然而,值得注意的是,香港大学公共卫生学院新发传染病国家重点实验室管轶教授、广西医科大学胡艳玲教授团队,以及华南农业大学、岭南现代农业科学与技术广东省实验室沈永义教授、肖立华教授团队另另有有1个研究小组此前均报告了发生于马来穿山甲的HCoV-19相关冠状病毒,哪些穿山甲通过非法走私进入广西和广东。

研究团队提到,尽管在全基因组水平上,哪些穿山甲中检测到的冠状病毒与HCoV-19的距离要远于RaTG13与HCoV-19的距离,但它们在S蛋白的受体结合域(RBD)上与HCoV-19非常类似于 。

并且,尽管目前还不清楚穿山甲有无HCoV-19传播到人过程中的中间宿主,但它们将会在冠状病毒的生态学和进化中发挥重要作用。

大伙儿认为,哪些在穿山甲中发现的病毒还促进表明,在野生动物中仍有一定量的冠状病毒样本,其中你什儿 将会直接参与了HCoV-19的再次老出。

HCoV-19和几种代表性蝙蝠来源冠状病毒序列比较。

一种新的蝙蝠来源冠状病毒,命名RmYN02

论文中提到,2019年5月至10月,研究团队从云南勐腊县的227只蝙蝠中一共采集了60 另另有有1个样本。哪些蝙蝠属于20个不同种类,大多数样本从马来菊头蝠Rhinolophus malayanus(n=48, 21.1%)、中蹄蝠Hipposideros larvatus (n=41,18.1%)和小褐菊头蝠Rhinolophus stheno(n=39,17.2%)中获得。样从前源于多种组织,包括翼膜(219)、肺(2)、肝(3)和粪便(78)。

除了3只蝙蝠外,其余所有蝙蝠均为在活着时取样并被释放。

利用新一代宏基因组测序技术,研究团队首先锁定了另另有有1个初步的一致序列。哪些序列产生的样从前自于2019年5月6日至7月60 日期间的11份马来菊头蝠粪便。经过一系列验证步骤,研究团队得到另另有有1个帕累托图(23395bp)和另另有有1个完全(29671bp)的蝙蝠冠状病毒基因组序列,分别命名为BetaCoV/Rm/Yunnan/YN01/2019 (RmYN01)和BetaCoV/Rm/Yunnan/YN02/2019 (RmYN02)。

相比之下,RmYN02与HCoV-19密切相关,表现出93.3%的核苷酸序列一致性,但从全长基因组层面来说,RaTG13和HCoV-19的一致性更高(96.1%)。RmYN02和HCoV-19在大多数基因组区域(如1ab、3a、E、6、7a、N和10)非常类似于 (>96%序列一致性)。特别是,RmYN02在最长编码基因区1ab (n=21285)与HCoV-19一致性达到97.2%。

不过,RmYN02和HCoV-19在S基因中的序列一致性(核苷酸71.8%,氨基酸72.9%)远低于RaTG13和HCoV-19之间的97.4%。另外值得注意的是,RmYN02和HCoV-19在RBD中的氨基酸同源性仅为62.4%。而来自广东的穿山甲冠状病毒和HCoV-19在RBD中的氨基酸同源性为97.4%,也是在RBD区域目前和HCoV-19最接近的。

围绕HCoV-19的同源模型、体外实验和S蛋白的三维型态分析结果都表明,HCoV-19和SARS-CoV一样,也还促进利用ACE2作为细胞受体。研究团队也同样使用同源模型分析了RmYN02、RaTG13和另另有有1个穿山甲CoVs的RBD。

RmYN02和代表性冠状病毒RBD型态的同源建模和型态比较。

研究发现,RmYN02 RBD中的氨基酸缺失在受体结合位点附过形成了另另有有1个比HCoV-19 RBD短的环。重要的是,在SARS-CoV、HCoV-19、RaTG13、穿山甲/MP789/2019、穿山甲/GX/P5L/2017的外子域(external subdomain )

保守的二硫键在RmYN02中缺失了。研究团队推测,哪些缺失将会原因分析 构象变化,从而减少RmYN02 RBD与ACE2的结合,甚至原因分析 不结合。

当然前要将会的一种情况汇报是,包括RmYN02、ZXC21和ZC45在内的环缺失的SARS相关冠状病毒,使用了一种大伙儿目前未知的受体。

值得一提的是,此前有研究认为,RBD中的6个氨基酸残基(L455、F486、Q493、S494、N60 1和Y60 5)是HCoV-19与ACE2有效受体结合的主要决定因素。与同源建模一致,穿山甲/MP789/2019在所有6个位置上都具有与HCoV-19相同的氨基酸残基。相比之下,RaTG13、RmYN02和RmYN01与HCoV-19均只在另另有有1个位置上有相同的氨基酸残基。

研究团队认为,你什儿 进化模式是重组和自然选则 的复杂性结合的表现。

系统发育树:a全长基因组;b、S基因;c、RBD ;d、RdRp(RNA依赖的RNA聚合酶)。

研究团队还对RmYN02、RaTG13、HCoV-19和穿山甲中的蝙蝠冠状病毒进行了系统发育分析。与先前的研究相符,穿山甲beta-CoVs形成另另有有1个亚型。然而,论文中提到,穿山甲有无哪些病毒的火山玻璃蓄水池,将会它们从蝙蝠或你什儿 野生动物中独立获得,这都前要进一步验证。

更值得注意的是,在大多数病毒基因组中,RmYN02与HCoV-19的亲缘关系最近,尽管什儿 种病毒之间仍然有一段较长的分支距离。S基因树显示,HCoV-19离RaTG13较近,和RmYN02较远,这表明后者在S基因经历了重组。在RBD的系统发育树上,HCoV-19和pangolin-CoV/GD最密切相关,与蝙蝠病毒都较远,再次表明重组发生。最后,完全的RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)基因(在RNA病毒的系统发育分析中时不时被使用)系统发育分析显示,RmYN02、RaTG13和HCoV-19形成了另另有有1个与穿山甲病毒完全不同的亚群。

HCoV-19是自然起源,将会通过重组获得

类似于 禽流感病毒(AIVs)血凝素(HA)蛋白的措施,冠状病毒的S蛋白在功能上分裂成另另有有1个亚基S1和S2。而在你什儿 AIV亚型的剪切位点上插入多碱基氨基酸被认为与增强致病性有关。

值得注意的是,HCoV-19的型态之一即为在S1和S2的交界处有另另有有1个四氨基酸的插入,这在你什儿 β冠状病毒的你什儿 谱系中没办法 观察到过。你什儿 被称为弗林蛋白酶剪切位点的插入是HCoV-19独有的,目前在所有检测的HCoV-19序列中都发现发生。

研究团队此番在RmYN02中S1和S2交界处也发现插入了另另有有1个残基PAA,大伙儿认为这是非常重要的。“人太好 HCoV-19插入的残基(以及由此产生的核苷酸)与RmYN02中的残基不同,但还促进表明它们是另另有有1个独立的插入事件,它们在野生动物(蝙蝠)中再次老出强烈表明它们是自然起源的,将会是通过重组获得的。”

并且,哪些数据有力地表明了HCoV-19的自然起源。

此外,研究团队再次选则 了RmYN02的蝙蝠宿主为马来菊头蝠(Rhinolophus malayanus),和一种马来菊头蝠标本中获得的序列(GenBank accession MK900703 )60 %一致。

马来菊头蝠和中华菊头蝠都广泛分布于中国西南部和东南亚地区。论文中提到,一般来说,哪些蝙蝠不要再长距离迁移,群居性很强,很将会生活在同另另有有1个洞穴中,这将会会促进它们之间的病毒交换和重组的发生。

值得注意的是,科学家从肛门拭子中发现了RaTG13,从粪便中发现了RmYN02。并且,粪便是是蝙蝠将病毒传播给你什儿 动物,特别是促进利用洞穴环境的物种的一种简单但可行的措施。

基于现有的数据,研究团队认为,HCoV-19将会来源于野生动物中多种自然发生的重组事件。来自蝙蝠的病毒将会提供了HCoV-19的基因骨架,与蝙蝠或你什儿 野生动物的进一步重组事件则原因分析 获得S蛋白、RBD和多碱基剪切位点。

首次揭秘!显微镜下新冠病毒的真实形貌竟是从前

近日,深圳国家感染性疾病临床医学研究中心/南方科技大学第二附属医院(深圳市第三人民医院)与南方科技大学联合,从临床新冠肺炎病例获取生物样本,首次使用冷冻电子显微镜观察到了新冠病毒经灭活后的真实形貌,为新冠病毒的识别、鉴定和临床相关研究提供重要的超微影像基础。

本文来源:澎湃新闻 责任编辑:李曦_NN2587